prof. Mgr. et Mgr. Josef Bryja Ph.D.
Pozice vědecký pracovník kmenový
Zaměření molekulární ekologie
Pracoviště Pracoviště Studenec
+420 560 590 601
Výzkumné směry
- fylogeografie, speciace, adaptace, taxonomie a fylogenetika drobných savců,
- biogeografie a distribuce biologické rozmanitosti v Africe,
- molekulární ekologie obratlovců (vztah neutrální a adaptivní variability, imunogenetika, ochranářská genetika, pohlavní výběr),
- ekologie savců, zejména hlodavců (poměr pohlaví, populační dynamika, struktura společenstev).
Probíhající projekty
Ukončené projekty
Vzdělání
- 1992-2000: Masarykova univerzita Brno, Přírodovědecká fakulta.
- 1992-1997: magisterské studium – Systematická biologie a ekologie. Diplomová práce: Struktura synuzií drobných zemních savců v různých biotopech CHKO Poodří, (Mgr.; vedoucí Z. Řehák).
- 1993-1998: magisterské studium – Molekulární biologie a genetika. Diplomová práce: Příprava zkrácené varianty genu pro retinoidový receptor RXR alpha a jeho přenos do monoblastové linie BM2, (Mgr.; vedoucí J. Šmarda).
- 1997-2000: postgraduální studium – Zoologie (zaměřeno na populační dynamiku hrabošovitých hlodavců). Doktorská práce: Demografická charakteristika populace hraboše polního (Microtus arvalis) na jižní Moravě, (Ph.D.; školitel J. Gaisler).
Zaměstnání
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v.v.i.:
- 1997-2000: odborný VŠ pracovník
- 2001-2010: vědecký pracovník, zodpovědný za provoz laboratoře molekulární genetiky na oddělení populační biologie ve Studenci
- 2010-současnost: vedoucí vědecký pracovník, vedoucí detašovaného pracoviště ÚBO AV ČR, v.v.i., ve Studenci
- 2011-2019: vědecký tajemník ÚBO AV ČR, v.v.i.
- 2012-současnost: předseda Rady ÚBO AV ČR, v.v.i.
Ústav botaniky a zoologie, Přírodovědecká fakulta MU, Brno:
- 2003-2009: odborný pracovník (částečný úvazek)
- 2009-současnost: docent (částečný úvazek)
- výuka: Molekulární ekologie (od r. 2015 s M. Macholánem a A. Konečným), Genetické metody v zoologii (s M. Macholánem), Pokroky ve výzkumu obratlovců (s T. Bartoničkou)
- školitel bakalářských, magisterských a postgraduálních studentů
Vědecká a organizační činnost
- pravidelný hlavní organizátor největší česko-slovenské zoologické konference Zoologické dny,
- recenzent článků v odborných časopisech a oponent grantových návrhů v ČR i EU,
- editor odborných časopisů Frontiers in Zoology, Mammalia, Journal of Vertebrate Biology
- oponent závěrečných studentských prací a člen zkušebních komisí v České republice, na Slovensku, ve Francii a v Belgii,
- školitel nebo konzultant 21 bakalářských, 27 magisterských a 17 PhD studentů na PřF MU Brno, PřF JU České Budějovice, PřF UK Praha a Université Montpellier II,
- hlavní organizátor mezinárodní konference 13th African Small Mammal Symposium v Mekele (Etiopie), září 2019
Vybrané mezinárodní zkušenosti a spolupráce
- 2004-2006: Centre de Biologie et Gestion des Populations, INRA, Montferriez-le-Lez, France (J.F. Cosson, N. Charbonnel).
- 2004-2009: zástupce České republiky v mezinárodním řídícím výboru vědeckého programu European Science Foundation „Integrating population genetics and conservation biology: Merging theoretical, experimental and applied approaches“.
- září 2008: organizace Letní školy ochranářské genetiky v Liblicích (podporováno European Science Foundation) za účasti studentů a školitelů z 19 evropských zemí.
- 2004-současnost: organizace či účast na 11 terénních expedicích v Africe (Senegal, Mosambik, Keňa, Etiopie, Tanzánie, Madagaskar), spolupráce s africkými, evropskými a americkými kolegy na výzkumu afrických savců.
- 2005-2013: školitel dvou doktorandů pod dvojím vedením na Université Motpellier II, Francie.
- krátké pracovní pobyty a zvané přednášky na evropských výzkumných institucích (Francie – CBGP, Université Montpellier, Muséum national d´Histoire naturelle, Université de Rennes; Dánsko – University of Aarhus; Belgie – University of Antwerp, Royal Belgian Institute for Natural Sciences, Brussels; Itálie – Centre for Research and Innovation, S. Michele all’Adige; Slovinsko – University of Koper aj.).
- 2009-2013: zástupce České republiky v konsorciu CONGRESS (Conservation of Genetic Resources for Effective Species Survival), projekt 7RP EU; 2012 – hlavní organizátor dvou mezinárodních workshopů zaměřených na ochranářskou genetiku (Slovensko, Maďarsko).
- 2018: CIBIO – Research Centre in Biodiversity and Genetic Resources, Porto, Portugal – hostující vědecký pracovník, 6 měsíců
- 2019-2023: člen mezinárodního řídícího výboru programu COST – CA18134 Genomic BIodiversity Knowledge for Resilient Ecosystems
Současní Ph.D. studenti
- Brosseau-Acquaviva Laura: Delimitation of Sudanian savanna phyloregions using rodents as a model group. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel)
- Mulualem Getachew: Evolution of rodent biodiversity in Eastern Afromontane Biodiversity Hotspots. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel)
- Králová Tereza: The effect of life histories on the variation of immune genes in passerines – a comparative approach, ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel, konzultanti T. Albrecht, M. Vinkler)
- Dianat Malahatosadat: Evolution of old placental lineages: insectivorous mammals in the Afrotropics. ÚBZ PřF MU, Brno. (konzultant, školitel: A. Konečný)
Bývalí Ph.D. studenti
- Mizerovská Daniela, 2023: Evolution at steep elevational gradients: assessing the role of genetic and ecological factors in speciation process. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel)
- Turbaková Barbora, 2023: Conservation genetics of European lynx in Central Europe. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel)
- Krásová Jarmila, 2023: Diversity and phylogeny of East African montane rodents/. KZ PřF JU, České Budějovice. (školitel-specialista, školitel R. Šumbera)
- Těšíková Jana, 2022: Diversity and evolutionary history of selected rodent-borne viruses/. ÚBZ PřF MU, Brno. (konzultant, školitelka J. Göuy de Bellocq)
- Hánová Alexandra, 2021: Factors affecting population genetic structure of rodents in savannahs. ÚBZ PřF MU, Brno. (konzultant, školitel A. Konečný)
- Mazoch Vladimír , 2019: Diversity, evolution, and distribution of selected African rodents, with focus on East African savannahs. KZ PřF JU, České Budějovice. (školitel specialista, školitel R. Šumbera)
- Aghová Tatiana, 2018: Comparative phylogeography of the Somali-Maasai region in eastern Africa using selected rodent species as a model, ÚBZ PřF MU, Brno (školitel, konzultant R. Šumbera)
- Bartáková Veronika, 2018: The effects of non-native species on host-parasite relationships, ÚBZ PřF MU, Brno (školitel, konzultant M. Reichard)
- Čížková Dagmar, 2015: Major histocompatibility complex variation in the house mice hybrid zone. ÚEB PřF MU, Brno. (školitel)
- Wasimuddin, 2014: Genetic variation of selected pathogens in the house mouse hybrid zone. (školitel, konzultanti J. Gouy de Bellocq and J. Piálek)
- Zemanová Barbora, 2014: Genetic structure of chamois populations in Central Europe. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel)
- Fornůsková Alena, 2013: Genes of innate immunity and their significance in evolutionary ecology of free living rodents. ÚBZ PřF MU, Brno a Université Montpellier II. (školitel, spolu s J. F. Cosson, doktorát pod dvojím vedením)
- Patzenhauerová-Konvičková Hana, 2013: Bathyergid rodents of mesic tropical regions: Phylogeography, kinship structure and mating systems. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel)
- Poláková Radka, 2011: The effect of genetic factors on reproductive success in a socially monogamous songbird. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel, konzultant T. Albrecht)
- Říčanová Štěpánka, 2011: Phylogeography and conservation genetics of the European ground squirrel. KZ PřF JU, České Budějovice. (školitel specialista, školitel F. Sedláček)
- Promerová Marta, 2011: Major histocompatibility complex genes: their variation and impact on fitness in a socially monogamous passerine. ÚBZ PřF MU, Brno. (školitel, konzultant T. Albrecht)
- Konečný Adam, 2009: Consequences of anthropogenic changes on rodent communities and populations: study cases on native and introduced species in Eastern Senegal. ÚBZ PřF MU, Brno a Université Montpellier II. (školitel, spolu s J. M. Duplantier a J. F. Cosson; doktorát pod dvojím vedením)
- Hájková Petra, 2008: Conservation genetics of the Eurasian otter. ÚBZ PřF MU, Brno. (konzultant, školitel P. Jurajda)
Publikace
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
2015
2014
2013
2012
Bryja J, Mazoch V, Patzenhauerová H, Mateke C, Zima Jr. J, Šklíba J, Šumbera R (2012).
Revised occurrence of rodents from the tribe Praomyini (Muridae) in Zambia based on mitochondrial DNA analyses: implications for biogeography and conservation. Folia zoologica, 61: 268-283.
Poláková R, Schnitzer J, Vinkler M, Bryja J, Munclinger P, Albrecht T (2012).
Effect of extra-pair paternity and parental quality on brood sex ratio in the scarlet rosefinch Carpodacus erythrinus. Folia zoologica, 61: 225-232.
2011
Zemanová B, Hájková P, Bryja J, Zima Jr. J, Hájková A, Zima J (2011).
Development of multiplex microsatellite sets for noninvasive population genetic study of the endangered Tatra chamois. Folia zoologica, 60: 70-80.
2010
Bartonička T, Kaňuch P, Bímová B, Bryja J (2010).
Olfactory discrimination between two cryptic species of bats Pipistrellus pipistrellus and P. pygmaeus. Folia zoologica, 59: 175-182.
Kaňuch P, Fornůsková A, Bartonička T, Bryja J, Řehák Z (2010).
Do two cryptic pipistrelle bat species differ in their autumn and winter roosting strategies within the range of sympatry?. Folia zoologica, 59: 102-107.
2009
2008
Jánová E, Heroldová M, Bryja J (2008).
Conspicuous demographic and individual changes in a population of the common vole in a set-aside alfalfa field. Annales Zoologici Fennici, 45: 39-54.
Řehák Z, Bartonička T, Bryja J, Gaisler J (2008).
New records of the Alcathoe bat, Myotis alcathoe in Moravia (Czech Republic). Folia zoologica, 57: 465-469.
Tóthová A, Knoz J, Sonnek R, Bryja J, Vaňhara J (2008).
Taxonomic problems in the subgenus Meloehelea Wirth of the genus Atrichopogon Kieffer (Diptera: Ceratopogonidae) inferred from both morphological and molecular characters. Entomologica Fennica, 19: 1-12.
2007
Bryja J, Kment P (2007).
True bugs (Heteroptera) of the Bukovské vrchy Hills (Poloniny National Park, Slovakia). Acta Musei Moraviae. Scientiae biologicae = Časopis Moravského muzea. Vědy biologické, iScientiae biologicae92: 1-51.
Kment P, Bryja J (2007).
Description of Nasocoris lautereri sp. nov. from the Balkan peninsula, with a review of the genus Nasocoris (Hemiptera: Heteroptera: Miridae: Phylinae). Zootaxa, 1633: 39-61.
2006
Bencová V, Kašpar T, Bryja J (2006).
Sezónní a meziroční změny skladby potravy kalouse ušatého (Asio otus) na jižní Moravě. Tichodroma, 18: 65-71.
Bryja J, Kment P (2006).
Ploštice (Heteroptera) Chráněné krajinné oblasti Kokořínsko. Bohemia centralis, 27: 267-2941210 .
Kment P, Bryja J (2006).
Revised occurrence of Heterotoma species (Heteroptera: Miridae) in the Czech Republic and Slovakia with remarks on nomenclature, diagnostic characters and ecology. Acta Musei Moraviae. Scientiae biologicae = Časopis Moravského muzea. Vědy biologické, iScientiae biologicae91: 7-52.
Tóthová A, Bryja J, Bejdák P, Vaňhara J (2006).
Molecular markers used in phylogenetic studies of Diptera with a methodological overview. Acta Universitatis Carolinae, Biologica, 50: 125-133.
2005
Bryja J, Stopka P (2005).
Facultative promiscuity in a presumably monogamous mouse Apodemus microps. Acta Theriologica, 50: 189-196.
Heroldová M, Jánová E, Bryja J, Tkadlec E (2005).
Set-aside plots - source of small mammal pests?. Folia zoologica, 54: 337-350.
Kment P, Bryja J, Hradil K, Jindra Z (2005).
New and interesting records of true bugs (Heteroptera) from the Czech Republic and Slovakia 3. Klapalekiana, 41: 157-2131210 .
Kment P, Bryja J, Jindra Z (2005).
New records of true bugs (Heteroptera) of the Balkan peninsula. Acta entomologica slovenica, 13: 9-20.
2004
Bryja J, Kment P (2004).
Ploštice (Heteroptera) Bukovských vrchů (NP Poloniny). Folia faunistica Slovaca, 9: 31-41.
Hájková P, Zemanová B, Hájek B, Roche K, Kučerová M, Bryja J, Zima J (2004).
Stanovenie početnosti a štruktúry populácie vydry riečnej (Lutra lutra) neinvazívnou genetickou metódou - správa o prebiehajúcom výskumnom projekte. Bulletin Vydra, 12001.
Hájková P, Hájek B, Zemanová B, Roche K, Toman A, Bryja J (2004).
Genetická variabilita a populačno-genetická štruktúra subpopulácií vydry riečnej (Lutra lutra) v výskumnom projekte Českej a Slovenskej republike. Bulletin Vydra, 12001.
Heroldová M, Zejda J, Zapletal M, Obdržálková D, Jánová E, Bryja J, Tkadlec E (2004).
Importance of winter rape for small rodents. Rostlinná výroba, 50: 175-181.
2003
Bryja J, Konečný A (2003).
Fast sex identification in wild mammals using PCR amplification of the Sry gene. Folia zoologica, 52: 269-274.
Jánová E, Heroldová M, Bryja J, Tkadlec E (2003).
Metodické problémy při určování stáří hlodavců na základě hmotnosti očních čoček. Lynx, 34: 29-38.
Kment P, Bryja J, Jindra Z, Hradil K, Baňař P (2003).
New and interesting records of true bugs (Heteroptera) from the Czech Republic and Slovakia 2. Klapalekiana, 39: 257-3061210 .
2002
Bartonička T, Řehák Z, Wolf P, Bryja J (2002).
Drobní savci CHKO Litovelské Pomoraví. Část 1. Netopýři - Chiroptera. Lynx, 33: 35-46.
Bryja J, Heroldová M, Zejda J (2002).
Effects of deforestation on structure and diversity of small mammal communities in the Moravskoslezské Beskydy Mts (Czech Republic). Acta Theriologica, 47: 295-306.
Bryja J, Kment P (2002).
New and interesting records of plant bugs (Heteroptera: Miridae) from the Czech and Slovak Republics. Klapalekiana, 38: 1-101210 .
Bryja J, Řehák Z (2002).
Další doklady současné expanze areálu myšice temnopásé (Apodemus agrarius) na Moravě. Lynx, 33: 69-77.
Bryja J, Řehák Z, Vermouzek Z, Wolf P, Bartonička T (2002).
Drobní savci CHKO Litovelské Pomoraví. Část 2. Hmyzožravci a hlodavci - Insectivora et Rodentia. Lynx, 33: 79-87.
Bryja J, Kment P, Hradil K (2002).
Ploštice (Heteroptera) Rokytenských slepenců. Přírodovědný sborník Západomoravského muzea v Třebíči=Acta Scientiarum Naturalium Musei Moraviae Occidentalis, 40: 33-60.
Konečný A, Bryja J (2002).
Hmyzožravci a hlodavci v ČR - souhrn nepublikovaných faunistických dat z diplomových prací obhájených na Přírodovědecké fakultě MU v Brně. Lynx, 33: 133-140.
Kula E, Bryja J (2002).
Comparison of various sampling methods for evaluation of biodiversity of true bugs (Heteroptera) in a birch forest. Ekológia, 21: 137-147.
2001
Bryja J, Heroldová M, Zejda J (2001).
Drobní zemní savci (Insectivora, Rodentia) vrcholových partií Moravskoslezských Beskyd. Časopis Slezského zemského muzea., iSérie A: Vědy přírodní50: 105-112.
Bryja J, Beneš B (2001).
The harvest mouse (Micromys minutus) in the mountains of the Czech Republic. Časopis Slezského zemského muzea., iSérie A: Vědy přírodní50: 113-116.
Bryja J, Kment P (2001).
The present state of knowledge of true bugs (Heteroptera) in the Protected Landscape Area of Poodří (Czech Republic). Klapalekiana, 37: 1-361210 .
Bryja J, Tkadlec E, Nesvadbová J, Gaisler J, Zejda J (2001).
Comparison of enumeration and Jolly-Seber estimation of population size in the common vole Microtus arvalis. Acta Theriologica, 46: 279-285.
Kment P, Bryja J (2001).
New and interesting records of true bugs (Heteroptera) from the Czech Republic and Slovakia. Klapalekiana, 37: 231-2481210 .
Lososová Z, Danihelka J, Chytrý M, Hluchý M, Vítek P, Marek J, Škorpík M, Bezděk J, Průdek P, Poisel J, Lauterer P, Bagar M, Kment P, Bryja J, Janšta P (2001).
Předběžné výsledky monitoringu biodiverzity vinic a přilehlých lesostepních lokalit CHKO Pálava a NP Podyjí. Thayensia, 4: 205-2081210 .
2000
Bryja J, Zukal J (2000).
Small mammal communities in newly planted biocorridors and their surroundings in southern Moravia (Czech Republic). Folia zoologica, 49: 191-197.
Bryja J, Kula E (2000).
A novel multiple approach to the biodiversity evaluation - example of the fractionated community of bugs Heteroptera). Ekológia, 19: 225-244.
1999
Bryja J, Zemanová K, Šmarda J (1999).
Antileukemické účinky proteinu RXR. Klinická biochemie a metabolismus, 7: 17.
Bryja J (1999).
Nejvýše položený nález myšice temnopásé (Apodemus agrarius Pallas, 1771) na území České republiky. Časopis Slezského zemského muzea., iSérie A: Vědy přírodní48: 223-226.
Šmarda J, Zemanová K, Bryja J, Šmardová J, Kozubík A, Hofmanová J, Nemajerová A, Ševčíková S, Kohoutek J, Vodička P (1999).
Retinoid X receptor suppresses transformation by the v-myb oncogene. Journal of Leukocyte Biology, 66: 1039-1048.
1998
Bryja J, Řehák Z (1998).
Community of small terrestrial mammals (Insectivora, Rodentia) in dominant habitats of the Protected Landscape Area of Poodří (Czech Republic). Folia zoologica, 47: 249-260.
Bryja J, Řehák Z (1998).
Drobní savci CHKO Poodří a blízkého okolí: 1. Insectivora, Rodentia. Časopis Slezského zemského muzea., iSérie A: Vědy přírodní47: 123-131.
Bryja J, Řehák Z (1998).
Diet composition of two owl species in the Odra river floodplain (Czech Republic). Buteo, 10: 97-102.
Řehák Z, Bryja J (1998).
Drobní savci CHKO Poodří a blízkého okolí: 2. Chiroptera. Časopis Slezského zemského muzea., iSérie A: Vědy přírodní47: 133-142.