Introgrese přes druhovou bariéru a její analýza ve vysokém rozlišení (2015-2017)

Projekt
Období
2015–2017
Poskytovatel grantu
Grantová agentura ČR
Číslo projektu
15-13265S
Interní číslo
G305
Řešitel
Stuart J.E. Baird, Ph.D.
Výzkumný směr
Biodiverzita

Cílem tohoto projektu je dovodit roli vnitrogenomového konfliktu při vzniku anebo prolomení druhových bariér. Genetické stopy křížení mezi anatomicky moderními lidmi a neandertálci podnítily silný zájem o detailní strukturu introgrese v genomech. Podobný výzkum jsme nedávno koncipovali u jediného hybridizačního systému s odpovídajícím genomovým rozlišením: evropské hybridní zóny domácích myší (HZ). Naše analýza o vysokém rozlišení umožňuje jednoznačné odlišení ancestrálního a introgresního polymorfismu, což je zásadním předpokladem pro pochopení historie druhů. Tento projekt vychází právě z tohoto unikátního genomového zdroje. K tomuto účelu budou využity stávající rozsáhlé databáze vzorků i dat z myší HZ doplněné o cílený sběr nového materiálu. Činnost dosud identifikovaných kandidátních genů bude podrobněji mapována pomocí cílených genetických studií („hybrid enrichment“ technologie) a dalších metod, kombinovaných s laboratorními kříženími a fylogeografickými analýzami kolonizační historie domácích myší.