Entodiniomorfní nálevníci jako opomíjená součást střevní mikrobioty afrických lidoopů

Souhrnným cílem projektu je utvoření celostního pohledu na vztah afrických lidoopů a jejich dosud opomíjených střevních symbiontů, entodiniomorfních nálevníků (EN). Popíšeme diverzitu a fylogeografii EN napříč širokou paletou hostitelských populací (Cíle 1, 2). Budeme také studovat energetický metabolismus a metabolickou kapacitu anaerobních derivátů mitochondrií (dále jen MRO, „mitochondrion-related organelles“) nálevníků (Cíl 3) a identitu a funkci jejich prokaryotních symbiontů (Cíl 4). Odhalíme tak úlohu, kterou EN v ekosystému střeva lidoopů plní. Přehledové schéma cílů projektu a jejich propojení s etapami projektu je v příloze Grafický plán práce. Cíl. 1 Popsat diverzitu a studovat fylogeografii EN šimpanzů a goril. Doposud bylo z lidoopů morfologicky popsáno šestnáct druhů EN v pěti rodech. Většinu diverzity EN lidoopů známe z goril, které ve svých střevech hostí najednou větší množství EN (čtyři druhy a více) a druhová skladba symbiontů se liší mezi jednotlivými populacemi hostitelů (7, 10, 11). Oproti tomu u šimpanzů nacházíme pouze dva druhy, Troglodytella abrassarti a Troglocorys cava (12, 17, 18). Molekulární data jsou vzácná a omezují se na několik málo izolátů druhu Troglodytella abrassarti (12, 17, 19, 20), druhu, který je nejen široce rozšířen u lidoopů v přírodě, ale je také jediným druhem, který přežívá u jedinců v zajetí. Popisy všech ostatních střevních EN z lidoopů jsou pouze morfologické a dosud neexistují žádná sekvenční data. Fylogeografická práce (12), která prozkoumala molekulární diverzitu T. abrassarti z pěti volně žijících populací šimpanzů, ukázala zajímavou shodu mezi fylogenezí EN a jejich hostitelů. Výzkumný úkol (VÚ) 1A: Z vzorků trusu všech poddruhů divokých šimpanzů a bonobů fixovaných v ethanolu a archivovaných na ÚBO získat sekvenční data Troglodytella abrassarti a Troglocorys cava (Sanger sekvenace) a využít je ke studiu kospeciace s hostiteli.